В конце марта состоялся вывоз готового второго опытного авиалайнера МС-21-300

Этот самолет для подготовленных аэродромов. Вы представьте пассажирскую дуру пассажировместимостью человек 200 плюс багаж, садящуюся на грунтовку. Это какой запас прочности надо иметь? Какие шасси? Это среднемагистральный самолет для коммерческих рейсов, который должен, по идее больше находиться в воздухе, чем на земле. Низкоплан с двигателями под крылом на пилонах проще и технологичней в плане конструкции. Например, легче организовать правильную центровку (у ТУ-154, где тяжеленный блок двигателей сзади приходилось учитывать и центровку при загрузке багажа и изменение ее в процессе полета, т.к. топливо вырабатывалось и т.д), меньше длина топливопроводов, ведь баки в крыле. Обслуживание такого двигателя удобнее на порядок. Недостатков два - тот, что вы написали и второй - управление при отказе одного из двигателей, но сейчас автоматика это компенсирует мгновенно. Недостаток заднего расположения двигателей - большая чувствительность к центровке, двигатель может захлебнуться при больших углах атаки, поскольку попадает в "затененную"зону от крыльев (это же касается и стабилизатора, который в данном случае находится на конце киля). Кстати, это вероятная причина гибели Ту-154 в Сочи.